土木水利学院成立于2000年,其前身是土木工程系和水利水电工程系。土木工程系成立于1926年,是清华大学历史最悠久的系科之一。当时,系内分为结构、铁路及道路、水利、市政卫生四个科,培养了很多优秀人才。1952年全国高校院系调整时,在水利学科的基础上成立了水利工程系,设河川及水力发电站建筑、水力动力装置专业。土木工程系设工业与民用建筑、建筑施工、给排水、暖通、建筑材料五个专业。60年代土木工程系和建筑系曾一度合并为土木建筑系,1970年改称建筑工程系。1980年建筑工程系分成建筑系、土木与环境工程系。1984年给排水专业分离后,恢复了土木工程系,同年水利工程系更名为水利水电工程系。1986年土木工程系增设“建筑管理”专业。2000年,为适应形势的需要,在土木工程系和水利水电工程系的基础上成立了土木水利学院,并在两系各自的工程管理相关专业的基础上成立了建设管理系。土木水利学院的成立,形成了“按一级学科建系,按二级学科建所,按相关一级学科群建院”的学科布局。在人才培养上,土木工程、水利水电工程、工程管理三个专业共同形成“工程技术加工程管理”的人才培养模式。在科学研究上,重视基础研究、注重工程应用、适应国家需求、推动学科发展。
